Organisasi kemahasiswaan menjadi wadah pembelajaran kepemimpinan, pengembangan karakter, serta penguatan soft skill mahasiswa.
Badan Eksekutif Mahasiswa sebagai organisasi eksekutif mahasiswa yang berperan dalam kepemimpinan dan advokasi mahasiswa.
Lembaga Dakwah Kampus yang bergerak di bidang keagamaan dan pembinaan spiritual mahasiswa.
Lingkar Ilmiah Mahasiswa STIKes YARSI (LIMSY) sebagai wadah pengembangan keilmuan dan penelitian mahasiswa.
Tanggap Gawat Darurat dan Punyuluh (Tangguh) merupakan unit kegiatan kemahasiswaan yang bergerak di bidang tanggap darurat dan penyuluhan sebagai edukator dan penolong bagi masyarakat.
Sentra Sahabat Jiwa (SAHAJA) merupakan unit kegiatan kemahasiswaan yang bergerak di bidang kesehatan jiwa dan pendampingan mahasiswa.
STIKes YARSI Pontianak memberikan dukungan penuh terhadap kegiatan kompetisi mahasiswa baik di tingkat lokal, regional, nasional, maupun internasional.
Seluruh biaya kompetisi mahasiswa akan difasilitasi dan ditanggung oleh kampus sesuai dengan ketentuan yang berlaku.